Športne komisije so organizirane znotraj Komiteja za šport. Komisije pokrivajo mednarodno uveljavljene potapljaške športne panoge, ki jih gojijo v potapljaških društvih SPZ. Naloge športnih komisij so organiziranje medklubskih in državnih tekmovanj, izvajanje selekcije za sestavo državne reprezentance, sledenje mednarodnim pravilom za posamezne športe in antidoping pravilom, skrbijo za licenciranje športnikov ter za prijavo le teh na mednarodna tekmovanja. Komisije sestavljajo športniki in funkcionarji, ki gojijo posamezne športe.
Potapljaške športe, ki jih gojimo v Sloveniji, pokrivajo naslednje komisije:
- Komisija za PP – prosto potapljanje,
- Komisija za PFFV – podvodno fotografijo, film in video,
- Komisija za PH – podvodni hokej,
- Komisija za PL – podvodni lov,
- Komisija za HPPP – hitrostno potapljanje in plavanje s plavutmi,
- Komisija za PO – podvodna orientacija.